เทศบาลตำบลแหลมฟ้าผ่าในครั้งแรกได้จัดตั้งเป็นสุขาภิบาล ตามประกาศกระทรวงมหาดไทย เมื่อวันที่ 18 กรกฎาคม 2537 และประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 11 ตอนที่ 82 ลงวันที่ 13 ตุลาคม 2537 ให้ชื่อว่า "สุขาภิบาลแหลมฟ้าผ่า" อำเภอพระสมุทรเจดีย์ จังหวัดสมุทรปราการ ต่อมาได้เปลี่ยนแปลงฐานะเป็น เทศบาล โดยพระราชบัญญัติเปลี่ยนแปลงฐานะของสุขาภิบาลเป็นเทศบาลตำบล พ.ศ. 2542 เมื่อวันที่ 24 พฤษภาคม 2542 มีเนื้อที่ 7 ตารางกิโลเมตร